W latach 80. XIX w. przekazano je do Muzeum Prowincjonalnego Prus Zachodnich w Gdańsku. Po odzyskaniu przez Polskę niepodległości, w Kościerzynie zorganizowano wystawę pt: „Wystawa przemysłu ludowego i sztuki wiejskiej”. Dzięki inicjatywie dr. Jerzego Knyba w 1963 roku w Liceum powstała izba regionalna, a pod koniec lat Izbę Pamięci Narodowej.
Na początku lat 90 zbiory zgromadzone w Izbach przeniesiono do Kościerskiego Domu Kultury przy ulicy Długiej. Okazało się jednak, że miejsce jest za małe. Podjęto więc decyzję o renowacji kościerski ratusz na nową siedzibę. Prace wykonywane w latach 1995-2000 pozwoliły na pokazanie najstarszego zabytku użyteczności publicznej w Kościerzynie. Uroczyste otwarcie odbyło się 17 lipca 2000 roku, a 27 października 2006 roku powołano Muzeum Ziemi Kościerskiej w Kościerzynie.
Oddziałem Muzeum Ziemi Kościerskiej jest Muzeum Kolejnictwa oraz jedyne w Polsce Muzeum Akordeonu.
W strukturach Muzeum działa także Informacja Turystyczna czynna w godzinach otwarcia muzeum:
Październik – Kwiecień
Poniedziałek – Piątek 8.00 – 16.00
Maj – Sierpień
Poniedziałek 10.00 – 16.00
Wtorek – Sobota 10.00 – 18.00
Niedziela 12.00 – 18.00
Wrzesień
Poniedziałek – Piątek 8.00 – 16.00
Sobota 10.00 – 18.00
Niedziela 12.00 – 18.00
Foto: R. Baranowski, Dep. Turystyki, UMWP